Was ist unterschied zwischen java ee wofür nehme

Was mein Vorredner geschrieben hat ist nicht ganz korrekt, mit Applets hat das nichts zu tun. Java EE ist im Prinzip nur eine Klassenbibliothek für Java, die einige Funktionen enthält, die für den Einsatz bei Servern interessant sind. Enterprise Java Beans und solche Geschichten benötigen Klassen aus der EE. Der eigentlich Compiler und die Laufzeitumgebung sind die der SE.

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Was ist der Unterschied zwischen Java und Java EE und wofür nehme ich was?

Java EE ist, soweit ich mich erinnere, nur von Vorteil, wenn du Applets machen willst, ansonsten reicht Java SE völlig.