Chillipflanze chillis schimmel innen

Ich bin aus Hobby Chilli Farmer. Ich Pflanze immer wieder die verschiedensten sorten doch jetzt ist zum ersten mal ein großes problem aufgedrehten. Ich habe dieses Jahr Habanero Cabinien Red gepflanzt und war natürlich über die mengen an früchten begeistert. Leider musste ich heute feststellen das an manchen pflanzen die Früchte von innen schimmeln. Also damit meine ich die kompletten samen in der chilli sind pech schwarz uns mit einem feinen schimmel netz überzocgen. Muss ich diese chillis nur entfernen oder gelich die ganze ernte vernichten?